Soy científico de datos en Edpuzzle, una empresa que crea herramientas de aprendizaje interactivas que permiten transformar cualquier video en una lección.
Mi camino hacia la ciencia de datos comenzó de manera poco convencional. Inicialmente estudiando para ser farmacéutico, mi curiosidad me llevó hacia la bioinformática estructural, estadística y desarrollo de software. Este interés finalmente me condujo a realizar un doctorado en Bioinformática. Durante mi doctorado, exploré el impacto del envejecimiento en la expresión genética, empleando técnicas como análisis de grafos, modelado bayesiano de series temporales, aprendizaje automático y modelos lineales generalizados.
Tras mi doctorado, me uní a NTT DATA en Barcelona como científico de datos centrado en aplicaciones sanitarias. Allí trabajé en predicción de la progresión de la enfermedad renal crónica, desarrollé módulos de análisis predictivo para una plataforma de ensayos clínicos, y ayudé a los trabajadores sociales a anticipar la institucionalización en personas mayores.
Además, he aplicado aprendizaje automático para predecir respuestas adversas a la quimioterapia usando marcadores genéticos, realizado modelado metabólico cinético y llevado a cabo simulaciones de farmacocinética.
Fuera de mi trabajo profesional, tengo una gran pasión por los idiomas. Hablo con fluidez francés, portugués, inglés, español y catalán, y también puedo mantener conversaciones en occitano y ruso.
Software
zebu: Paquete de R para estimar medidas de asociación local como residuos de chi-cuadrado, D de Lewontin, información mutua puntual y Z de Ducher. También incorpora pruebas de permutación para la evaluación de significancia estadística escritas en C++. Disponible en CRAN con una detallada vignette para explicar su uso.trobalècte: Actualmente estoy desarrollando un algoritmo en Python para detectar dialectos occitanos a partir de muestras de texto utilizando NLP.isotela: Paquete de R para la normalización y análisis diferencial de datos de RNA-seq de individuos únicos, teniendo en cuenta las diferencias en el tamaño del tejido. Requiere de spike-ins.wpbd: Transforma los datos del Wiktionary en un diccionario compatible con PocketBook.poète-mécanique: Lee un poema al azar en voz alta cuando el sensor de movimiento de Raspberry Pi detecta movimiento.
Publicaciones revisadas por pares
Similarities and differences in the gene expression signatures of physiological age versus future lifespan. Mosley, Matthew C., Holly E. Kinser, Olivier MF Martin, Nicholas Stroustrup, Tim Schedl, Kerry Kornfeld, Zachary Pincus. Aging Cell (2024).
Systematic mapping of organism-scale gene-regulatory networks in aging using population asynchrony. Eder, Matthias, Olivier MF Martin, Natasha Oswal, Lucia Sedlackova, Cátia Moutinho, Andrea Del Carmen-Fabregat, Simon Menendez Bravo, Arnau Sebé-Pedrós, Holger Heyn, Nicholas Stroustrup. Cell (2024).
The unusual kinetics of lactate dehydrogenase of Schistosoma mansoni and their role in the rapid metabolic switch after penetration of the mammalian host. Bexkens, Michiel L, Olivier MF Martin, Jos M van den Heuvel, Marion GJ Schmitz, Bas Teusink, Barbara M Bakker, Jaap J van Hellemond, Jurgen R Haanstra, Malcolm D Walkinshaw, Aloysius GM Tielens. International Journal for Parasitology (2024).
Neuronal Temperature Perception Induces Specific Defenses That Enable C. elegans to Cope with the Enhanced Reactivity of Hydrogen Peroxide at High Temperature. Servello, Francesco A, Rute Fernandes, Matthias Eder, Nathan Harris, Olivier MF Martin, Natasha Oswal, Anders Lindberg, et al. eLife 11 (2022).
A Hierarchical Process Model Links Behavioral Aging and Lifespan in C. elegans.Oswal, Natasha, Olivier MF Martin, Sofia Stroustrup, Monika Anna Matusiak Bruckner, and Nicholas Stroustrup. PLOS Computational Biology 18, no. 9 (2022).
Caenorhabditis elegans Processes Sensory Information to Choose between Freeloading and Self-Defense Strategies. Schiffer, Jodie A, Francesco A Servello, William R Heath, Francis Raj Gandhi Amrit, Stephanie V Stumbur, Matthias Eder, Olivier MF Martin, et al. eLife 9 (2020).
Implication of Terminal Residues at Protein-Protein and Protein-DNA Interfaces. Martin, Olivier MF, Loïc Etheve, Guillaume Launay, and Juliette Martin. PLOS ONE 11, no. 9 (2016).
Are Ciprofloxacin Dosage Regimens Adequate for Antimicrobial Efficacy and Prevention of Resistance? Pseudomonas aeruginosa Bloodstream Infection in Elderly Patients as a Simulation Case Study. Cazaubon, Yoann, Laurent Bourguignon, Sylvain Goutelle, Olivier MF Martin, Pascal Maire, and Michel Ducher. Fundamental & Clinical Pharmacology 29, no. 6 (2015).