Soy un científico de datos senior especializado en el sector de la salud en NTT DATA en Barcelona. Actualmente estoy desarrollando módulos de análisis predictivo para una plataforma de ensayos clínicos. Además, he implementado un dashboard con aprendizaje automático para ayudar a los trabajadores sociales a anticipar la institucionalización en personas mayores. También participé en el Hackathon de IA SmartNation en Bélgica, centrándome en la estructuración de datos clínicos de texto libre utilizando large language models.
Mi camino hacia la ciencia de datos comenzó de una manera poco convencional. Inicialmente estudiando para ser farmacéutico, mi curiosidad me llevó hacia la bioinformática estructural, la estadística y el desarrollo de software. Este cambio me llevó a realizar un Doctorado en Bioinformática. A lo largo de mi trabajo doctoral, exploré el impacto del envejecimiento en el transcriptoma de Caenorhabditis elegans, empleando varias técnicas como análisis de grafos, modelado de series temporales bayesianas, aprendizaje automático y modelos lineales generalizados.
Durante mi carrera, también apliqué aprendizaje automático para predecir respuestas adversas a la quimioterapia utilizando marcadores genéticos, realicé modelado metabólico cinético y llevé a cabo simulaciones de farmacocinética.
Aparte de mis objetivos profesionales, tengo una pasión por los idiomas. Hablo con fluidez francés, portugués, inglés, español y catalán, y también puedo mantener una conversación en occitano y ruso.
Software
zebu: Paquete de R para estimar medidas de asociación local como residuos de chi-cuadrado, D de Lewontin, información mutua puntual y Z de Ducher. También incorpora pruebas de permutación para la evaluación de significancia estadística escritas en C++. Disponible en CRAN con una detallada vignette para explicar su uso.trobalècte: Actualmente estoy desarrollando un algoritmo en Python para detectar dialectos occitanos a partir de muestras de texto utilizando NLP.isotela: Paquete de R para la normalización y análisis diferencial de datos de RNA-seq de individuos únicos, teniendo en cuenta las diferencias en el tamaño del tejido. Requiere de spike-ins.poète-mécanique: Lee un poema al azar en voz alta cuando el sensor de movimiento de Raspberry Pi detecta movimiento.
Publicaciones revisadas por pares
Systematic mapping of organism-scale gene-regulatory networks in aging using population asynchrony. Eder, Matthias, Olivier MF Martin, Natasha Oswal, Lucia Sedlackova, Cátia Moutinho, Andrea Del Carmen-Fabregat, Simon Menendez Bravo, Arnau Sebé-Pedrós, Holger Heyn, Nicholas Stroustrup. Cell (2024).
The unusual kinetics of lactate dehydrogenase of Schistosoma mansoni and their role in the rapid metabolic switch after penetration of the mammalian host. Bexkens, Michiel L, Olivier MF Martin, Jos M van den Heuvel, Marion GJ Schmitz, Bas Teusink, Barbara M Bakker, Jaap J van Hellemond, Jurgen R Haanstra, Malcolm D Walkinshaw, Aloysius GM Tielens. International Journal for Parasitology (2024)
Neuronal Temperature Perception Induces Specific Defenses That Enable C. elegans to Cope with the Enhanced Reactivity of Hydrogen Peroxide at High Temperature. Servello, Francesco A, Rute Fernandes, Matthias Eder, Nathan Harris, Olivier MF Martin, Natasha Oswal, Anders Lindberg, et al. eLife 11 (2022)
A Hierarchical Process Model Links Behavioral Aging and Lifespan in C. elegans.Oswal, Natasha, Olivier MF Martin, Sofia Stroustrup, Monika Anna Matusiak Bruckner, and Nicholas Stroustrup. PLOS Computational Biology 18, no. 9 (2022)
Caenorhabditis elegans Processes Sensory Information to Choose between Freeloading and Self-Defense Strategies. Schiffer, Jodie A, Francesco A Servello, William R Heath, Francis Raj Gandhi Amrit, Stephanie V Stumbur, Matthias Eder, Olivier MF Martin, et al. eLife 9 (2020)
Implication of Terminal Residues at Protein-Protein and Protein-DNA Interfaces. Martin, Olivier MF, Loïc Etheve, Guillaume Launay, and Juliette Martin. PLOS ONE 11, no. 9 (2016).
Are Ciprofloxacin Dosage Regimens Adequate for Antimicrobial Efficacy and Prevention of Resistance? Pseudomonas aeruginosa Bloodstream Infection in Elderly Patients as a Simulation Case Study. Cazaubon, Yoann, Laurent Bourguignon, Sylvain Goutelle, Olivier MF Martin, Pascal Maire, and Michel Ducher. Fundamental & Clinical Pharmacology 29, no. 6 (2015)